Zyra për Buxhet dhe Financa është përgjegjës për Menaxhimin dhe Raportimin Financiar për fondet e UHZ-së të siguruara nga Buxheti i Kosovës, Kontrollimin e të hyrave të përcaktuara sipas Statutit, dhe grantet e dhuruara nga donatorët. Mbikëqyr dhe zhvillon më tej proceset financiare dhe transaksionet e UHZ-së, është përgjegjës për sigurinë dhe ruajtjen e Fondeve. Përgjegjësitë e Zyrës për Buxhet dhe Financa ndër tjera përfshijnë: 1.1. Planifikimin dhe hartimin e buxhetit vjetor në bashkëveprim me mbajtësit e buxhetit dhe Menaxhmentin e UHZ-së, dizajnimin e moduleve financiare kontrolluese lidhur me pagesat, tarifat administrative dhe transaksionet tjera; 1.2. Menaxhimin dhe Raportimin Financiar për fondet e UHZ-së të siguruara nga Buxheti i Republikës së Kosovës, të hyrat e përcaktuara sipas Statutit, dhe grantet e dhuruara nga donatorët; 1.3. Administrimin financiar të Fondeve të UHZ-së; 1.4. Zhvillimin e duhur të sistemit të kontabilitetit dhe bazave tjera të të dhënave financiare për fondet e Buxhetit të Republikës së Kosovës, të hyrat e përcaktuara sipas Statutit të UHZ-së, si dhe fondet e donatorëve; 1.5. Ofrimin e këshillave financiare për Menaxhmentin dhe nëpunësit e UHZ-së.
Drejtori i Zyrës për Buxhet dhe Financa raporton te Sekretari i Përgjithshëm, ndërsa konsultohet dhe i koordinon punët me Prorektorin për Buxhet, Financa dhe Infrastrukturë.
Me sistematizimin e vendeve të punës, Zyra për Buxhet dhe Financa përbëhet nga këto pozita: 3.1 Drejtor i Zyrës për Buxhet dhe Financa; 3.2 Zyrtar i Shpenzimeve; 3.3 Zyrtar për të hyra; 3.4 Zyrtari Zotues; 3.5 Zyrtar për Paga; 3.6 Zyrtar i Pasurive; 3.7 Arkatari.
Numri i të punësuarve në Zyrën për Buxhet dhe Financa, është shtatë (7).